Как утюжком уложить каре: Укладка каре в домашних условиях: 5 пошаговых инструкций

7 идей, как стильно уложить каре своими руками – HEROINE

Каре — одна из самых стильных стрижек, которая уже много лет не теряет своей актуальности. Но многие девушки не решаются на эту стрижку, так как боятся, что больше не смогут экспериментировать с прическами. В материале приводим несколько примеров простых и красивых укладок для коротких волос, которые развеют сомнения.

1. Каре с пляжными локонами

Пляжные локоны — трендовая летняя прическа, которая подойдет для волос любой длины и структуры. Чтобы сделать эту укладку на стрижку каре, тебе понадобится не больше 15 минут.

Как сделать

Перед укладкой помой волосы и тщательно высуши их феном. Затем утюжком для волос поочередно накрути небольшие локоны по всей длине. Важно закручивать их в направлении от себя, иначе достичь нужного эффекта не получится.

Когда локоны будут сформированы, кончики волос вытяни утюжком и расчеши укладку по всей длине. Зафиксируй прическу небольшим количеством лака для волос.

У затылка часть волос можно собрать при помощи заколки-краба. Так прическа будет выглядеть еще более эффектно и по-летнему.

2. Укладка прядями к затылку

Этот вариант укладки идеально подойдет на случай, если тебе нужно быстро собраться на важное вечернее мероприятие. Чтобы создать прическу самостоятельно, понадобятся расческа, пенка и лак для волос.

Как сделать

На мокрые волосы нанеси мусс, а затем высуши пряди на круглую щетку-браш. В процессе сушки зачесывай волосы назад, чтобы придать им нужную форму. Когда волосы будут сухими, сбрызни их лаком для сильной фиксации и прочеши к затылку пальцами или расческой с редкими зубьями. Сбоку прическу можно дополнить трендовыми крупными заколками.

3. Каре с высоким хвостиком

Этот вариант трендовой прически вдохновлен эстетикой конца 90-х — начала 2000-х. Каре с высоким хвостиком подойдет как светловолосым девушкам, так и брюнеткам. Такая прическа хорошо дополнит образ с винтажной одеждой или аутфтит в стиле нулевых.

Как сделать

Чтобы сделать прическу, достаточно собрать часть волос на затылке настолько высоко, насколько позволяет длина. При желании можно оставить у лица две пряди волос. Кончики нужно либо уложить феном, либо слегка накрутить утюжком или плойкой.

4. Каре кончиками внутрь

Такой вариант прически хорошо подходит для создания как повседневного, так и делового образа. Каре с кончиками внутрь выглядит очень аккуратно и женственно.

Как сделать

Чтобы сделать прическу, хорошо помой голову и дай волосам немного высохнуть самостоятельно. Затем раздели их прямым пробором и вооружись круглой расческой с короткими зубьями и феном. Суши волосы как обычно, чуть больше внимания уделяя кончикам. Их нужно укладывать внутрь, задерживая фен у расчески на пять-семь секунд. Зафиксировать результат можно утюжком или крупной плойкой.

5. Романтические волны и косой пробор

Такой вариант укладки подойдет тем, кто собирается на прогулку или свидание. Косой пробор придает образу сексуальности, а крупные волны — женственности и легкости.

Как сделать

Чтобы сделать укладку, распредели по всей длине влажных волос мусс средней фиксации. Затем используй фен и круглую расческу, чтобы высушить волосы и придать им необходимую форму. У корней волос для дополнительного объема можно сделать начес.

Идеальный косой пробор начинается примерно у основания брови с той стороны, откуда ты зачесываешь волосы. Но ориентироваться нужно на длину и густоту волос.

6. Кудрявое каре

Кудри — один из главных трендов этого лета в hair-индустрии. Но если от природы тебе не достались волнистые волосы, не стоит переживать. Чтобы сделать стильную прическу, понадобятся бигуди или плойка.

Как сделать

Для начала, раздели волосы на несколько частей: затылочную, боковую, верхнюю. Начинай накручивать бигуди так, чтобы волосы фиксировались приподнятыми у корней и дополнительно фиксируй их лаком. Если используешь плойку, делай завитки не слишком объемными — так кудри будут выглядеть более естественно и пышно. В качестве аксессуара можно использовать либо бандану, либо крупную резинку из шелка или бархата.

7. Прическа с тонкими косичками у лица

Маленькие косички у лица — еще один простой и актуальный способ освежить образ. Такая прическа идеально подойдет для вечеринки или прогулки у пляжа.

Как сделать

Чтобы сделать прическу, с обеих сторон отдели равные тонкие пряди волос и сплетни их в тугие косички. Концы косичек можно либо укрепить лаком, либо завязать маленькими резинками. В качестве дополнительных аксессуаров можно использовать бусы или заколки.

Читать по теме:12 причесок, которые придадут волосам объем

Добавить в избранное

Поделиться

Статьи по теме:

Как уложить волосы без фена и утюжка: советы стилиста

Далеко не у всех из нас руки растут из «правильного места», поэтому красиво уложить волосы феном или плойкой становится настоящей проблемой. К счастью, выход есть. Стилист Wella Professionals показал нам, как сделать эффектную прическу, имея в своем арсенале только расческу и фиксирующие средства. Оказывается, это проще простого!

Редакция сайта

Теги:

Красота

Волосы

Прически

Лайфхаки

Уход за волосами

Еще наши бабушки спали на бигуди, что, согласись, не очень удобно! Мы же узнали у стилиста, как красиво уложить волосы без фена вечером, чтобы при этом спать спокойно, а с утра выглядеть настоящей королевой.

Диана Симонян

топ-стилист Wella Professionals, Студия красоты Марины Амирбеговой

Укладка для прямых волос средней длины

Эту укладку ты можешь сделать, помыв голову перед сном: просто следуй нашей инструкции и на утро потратишь всего пять минут, чтобы «собрать» прическу.

До

Item 1 of 3

1 / 3

Чистые волосы раздели на пять частей. Каждую из отделенных частей обработай сахарным спреем Sugar Lift EIMI от Wella Professionals, начиная от верхней части уха до кончиков

После

Немного плетения вечером, и вот тебе даже не понадобились дорогостоящие бьюти-гаджеты — получается укладка без плойки! Результат выходит отличный — игривая прическа в стиле гранж. Дополни образ модной косухой, и вперед — покорять сердца!

Укладка для длинных прямых волос

Даже самые непослушные прямые волосы можно сделать кудрявыми, не прибегая к помощи плойки для завивки. Достаточно перед сном создать «прическу» в стиле Майли Сайрус, а утром превратиться в кудрявую принцессу! Вот такая симпатичная укладка без утюжка и фена.

До

Item 1 of 3

1 / 3

Чистые волосы раздели на 6 частей. Каждую из частей обильно обработай сахарным спреем Sugar Lift EIMI от Wella Professionals

После

Именно эта техника помогает достичь максимально естественной волны. Запоминай, как сделать укладку волос без фена с минимальными усилиями — это может спасти в самых экстренных ситуациях, когда нужно быть особенно красивой.

Укладка для кудрявых волос

Думаешь, что укладывать вьющиеся волосы без фена — невыполнимая миссия? Наша задача сделать кудрявые волосы более структурными и пышными. Для этого тебе нужно выполнить несколько простых шагов.

До

Item 1 of 3

1 / 3

Чистые волосы расчеши и разделили на небольшие пряди. Каждую прядь по отдельности обработай сахарным спреем Sugar Lift EIMI от Wella Professionals, чтобы создать текстурные завитки

После

Вот такой кудряшкой Сью ты можешь стать! Главное — помнить, что кудрявые волосы лучше укладывать с муссом. Так укладка волос без утюжка и фена продержится дольше и порадует воздушностью и объемом.

Укладка для коротких волос

Как уложить короткие волосы без фена? Эту стильную укладку ты можешь быстро сделать с утра: понадобится всего 10 минут, расческа и лак для волос.

До

Item 1 of 3

1 / 3

Раздели волосы на три зоны — две височных и теменную

После

Макияж моделей: Анастасия Винникова, визажист бренда Urban Decay.

Железный повар СинБио | Каретка Тире Каретка

Архив

Лента

Lab обычно выпускается ярких неоновых цветов, но мне хотелось чего-то более индивидуального, тонкого и веселого. Итак, я получил красивую ленту васи от uguisu.

Плюсы:

• Они немного менее липкие, чем обычные лабораторные ленты, но при этом хорошо прилипают ко всему, от стеклянной посуды до картонных коробок.

Лабораторные маркеры

• VMR очень хорошо пишут на них, как и маркеры Sharpie.
• Они не оставляют следов при отклеивании, как обычная липкая лента.
• Они могут выжить в морозильной камере -4C, а также в теплых шейкерах при 37C. Хотя, если их оставить в теплом помещении, их будет немного сложнее очистить (все равно не останется следов). Я не тестировал ленту в морозильных камерах -80C.
• У них красивые узоры.

Минусы:

• Ленты Washi немного прозрачны. Скрыть текст на заднем плане сложнее.

В целом, я думаю, что использовать ленту васи в лаборатории — восхитительно. Это небольшая, аккуратная комбинация науки и ремесел. Один взгляд на дизайн оксалиса, и вы поймете, что это мои тарелки.

Sascha Willuweit написал что-то похожее на ABSee.

Судя по всему, он имеет

более общую поддержку файлов ABIF, включая новые зашифрованные файлы

Я еще не устанавливал его, но он звучит более обобщенно и включает тесты.

Git: https://github.com/545ch5/ABIF

Gem: http://rubygems.org/gems/ABIF

Проверьте это!

absee претерпел множество структурных изменений.

Во-первых, он извлекает только нужную информацию вместо того, чтобы возвращать все трассировки и вызываемые базы.
Во-вторых, теперь это класс, поэтому вы можете хранить несколько данных секвенирования.
В-третьих, теперь у него есть показатели качества.

%irb
>> требуется «отсутствовать»
=> правда
>> my_variable = ABSee. new()
=> #
>> my_variable.read("/Пользователи/Дженни/Рабочий стол/my_sequence.ab1")
=> ноль
>> my_variable.get_callSequence()
 

Методы класса

• read(file_location)
  • возвращает ноль
• get_traceA()
  • возвращает массив с данными трассировки для аденина
• get_traceG()
  • возвращает массив с данными трассировки для гуанина
• get_traceC()
  • возвращает массив с данными трассировки для цитозина
• get_traceT()
  • возвращает массив с данными трассировки для тимина
• get_callSequence()
  • возвращает массив с последовательностью Basecalled
• get_qualityScores()
  • возвращает массив с показателями качества Basecall
• get_peakIndexes()
  возвращает массив с индексами вызываемой последовательности в трассе

20 ноября 2012 г.

Iron Chef SynBio

Введение

Название GATTACA, фильма о генетически совершенной антиутопии, было основано на четырех нуклеотидах в ДНК. Многие предполагают, что название было вдохновлено GATATC, последовательностью распознавания ДНК рестриктазы EcoRV. Поскольку GATATC отличается от GATTACA несколькими парами оснований, мне стало любопытно посмотреть, будет ли какой-либо рестрикционный фермент использовать GATTACA в качестве своей последовательности распознавания.

Методы

Недолгий поиск в системе поиска ферментов NEB обнаружил BsaBI.

BSABI имеет следующую последовательность распознавания:

G A T N N / N N A T C
C T A N N / N N T A G

Это красиво охватывает GATTACA с его неспецифическими основаниями:

G A T T T A / C A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A .

Например, следующая цепь ДНК длиной 60 п.н. при расщеплении с помощью BsaBI даст нити длиной 24 п.н. и нити длиной 36 п.н., видимые на гелях высокой плотности.

5′ -TCGTACTTCGGCTCTACCA GATTA/CA ATGGCCATTGTAATCTGGTAGAGCCGAAGTACGA -3 ′

5′ -TCGTACTTCGGCTCCA GATTA -3 ‘

5′ — CATGTGCGCCGCCGCGCGCGCGCGCGCGATGCGATGCGATCGATCGATCGA .

[снова обновлен как класс Ruby]

absee имеет обновление!

Версия 0.1.0.0 теперь инкапсулирует методы в модуль Ruby, а не в глобальные функции.

Пример использования:

% irb
>> require ‘absee’
=> true
>> Absee.readAB(«/Users/Jenny/Desktop/my_sequence.ab1″)

Он по-прежнему возвращает шесть массивов (значения трассировки для ACGT, называемый последовательностью, и пиковые индексы).

Дополнительную информацию можно найти в моем предыдущем посте.

Спасибо Дэну Кахуну за разветвление моего абзаца на github.

Введение

В своем предыдущем посте я предположил, что можно легко напечатать структуру фермента на 3D-принтере с помощью файла Protein Data Bank (PBD). Теперь, спустя месяц и много итераций, я, наконец, смог напечатать рестриктазу Fok1 [PDB ID:1fok], связанную с цепью ДНК. Когда я впервые начал эту экспедицию, я не предвидел проблем с 3D-печатью такой сложной структуры, и теперь у меня есть очень надежный и простой способ печати этих структур.

Результат

Распечатанная модель Fok1 [PDB ID:1fok] выполнена из белого пластика Sculpteo и имеет размеры примерно 4,8 см x 4,0 см x 4,3 см. Он имеет слегка грубую и зернистую текстуру, но все еще сохраняет мелкие детали, такие как наконечники стрел на модели. Одним из факторов, который меня удивил, является гибкость модели. В то время как мои предыдущие напечатанные модели были жесткими, эта напечатанная белковая нить имеет пружинящее поведение в определенных областях и может выдерживать серьезное растяжение.

Краткое изложение метода

Моя цель состояла в том, чтобы оптимизировать простоту методологии преобразования PDB в 3D-модель. Это означает, что мне нужна минимальная ручная настройка вершин для рендеринга PDB. Кроме того, я хотел напечатать модель в виде ленты, которую было сложнее распечатать, чем модель на основе сетки, из-за ее тонких компонентов.

Я начал с рендеринга Fok1 [PBD ID:1fok] в Chimera. Chimera может удобно экспортировать модель в формат STL, идеально подходящий для 3D-печати. Перед экспортом я утолщил модель, чтобы она соответствовала минимальным требованиям к тонкости. Наконец, я загрузил STL в Sculpteo для печати.

Модель Fok1 на Sculpteo

Детали метода

1. Импорт PBD-файла в Chimera путем извлечения файла из PDB или пользовательского PDB-файла.
2. Выберите цепочки, содержащие ДНК или субстрат, и скройте модели атомов и связей. Модели атомов и связей обычно слишком тонкие, чтобы их можно было напечатать без дополнительной обработки.

1. Выберите оставшуюся модель ленты и настройте атрибуты модели ленты в меню Инструменты > Изображение > Редактор стилей ленты. Ленточная модель слишком тонкая для печати. Все атрибуты должны быть утолщены. Ниже приведены настройки, которые я использовал для своей модели Fok1.

1. Экспортируйте сцену в STL, а затем загрузите модель в Sculpteo для печати. Sculpteo предлагает красивую проверку пригодности модели для печати почти в реальном времени, что позволяет сократить время обратной связи по дизайну.

Предостережения

Основные проблемы, с которыми я столкнулся, заключались в слишком тонких структурах для печати. Сначала я пробовал печатать с Shapeways. Однако первые ~10 итераций даже не прошли стадию ручной проверки. Печать проволочной белковой структуры определенно расширяет границы возможностей 3D-печати. В конце концов я решил переключиться на Sculpteo из-за их значительно более быстрого времени выполнения работ. Sculpteo был потрясающим и определенно доставлен.

[обновлено: Фермент, напечатанный на 3D-принтере — Доказательство концепции]

Введение

Во время анимации короткометражки для команды MIT iGem 2011 года мне пришла в голову идея 3D-печати ферментов из огромного количества структур- охарактеризованные белки в банке данных белков RCSB (PDB). Существует множество удобных программ для преобразования файлов PDB в великолепные 3D-модели. Экспорт этих моделей для совместимости с 3D-печатью осуществляется всего в несколько кликов.

EcoRV [ID PDB: 1RVA]

Методы

Самый простой подход — использовать USCF Chimera для рендеринга белка из PDB. Chimera может экспортировать белок в файл STL, который можно загрузить в Shapeways или других поставщиков 3D-печати для печати.

Хотя Chimera очень красиво отображает ленточные диаграммы, ей не хватает более сложной визуализации на основе сетки и пользовательской настройки. Молекулярная Maya может быть хорошей альтернативой. Он использует все возможности настройки Maya, легко импортируя файлы PDB. Чтобы пойти по пути Molecular Maya, белки можно экспортировать в файлы OBJ для загрузки в Shapeways. В настоящее время Molecular Maya не отображает ленточные диаграммы или вторичную структуру.

ecoRV, визуализированный с помощью mMaya [ID PDB: 1RVA]

Галерея

ДНК-лигаза [ID PDB: 1DGS]

EcoRI [ID PDB: 1ERI]

Обновление:

Graphviz теперь поддерживает SBOLv 1.0!

Я реализовал символы открытого языка синтетической биологии (SBOLv) для Graphviz, чтобы легко создавать диаграммы, совместимые с SBOLv.

см. мой оригинальный пост об использовании Graphviz для рисования генетических цепей

Символы экспрессии генов:

орграф G {
рангдир = LR;

промоутер -> оператор [стрелка = нет];
оператор -> cds [стрелка=нет];
cds -> utr [стрелка=нет];
utr -> терминатор [стрелка=нет];

промоутер [shape=promoter labelloc="b"];
оператор [форма=ширина квадрата=0,2 метка=""];
компакт-диски [форма = компакт-диски];
утр [форма=утр labelloc="b"];
терминатор [форма=терминатор labelloc="b"];

}
 

орграф G {
рангдир = LR;

изолятор -> рибозит [стрелка = нет];
рибозит -> rnastab [стрелка = нет];
rnastab -> протеазит [стрелка = нет];
протеазезит -> протеинстаб [стрелка = нет];

изолятор [shape=insulator label=""];
рибозит [shape=рибозит label="сайт рибонуклеазы" labelloc="b"];
rnastab [shape=rnastab label="стабильность РНК" labelloc="b"];
протеазит [shape=proteasesite label="протеазный сайт" labelloc="b"];
протеинстаб [shape=proteinstab label="стабильность белка" labelloc="b"];

}
 

Символы конструкции ДНК:

орграф G {
рангдир = LR;

происхождение -> праймерсайт [стрелка=нет];
праймерсайт -> сайт рестрикции [стрелка=нет];
сайт ограничений -> ненависание [стрелка = нет];
нависание -> сборка [стрелка=нет];

происхождение [форма=ширина круга=0,2 метка=""];
праймерсайт [shape=primersite label="праймерсайт" labelloc="b"];
сайт ограничений [shape=сайт ограничений label="сайт ограничений" labelloc="b"];
выпуклость [форма = метка выпуклости = ""];
сборка [shape=assembly label=""];

}
 

орграф G {
рангдир = LR;

Fivepoverhang -> подпись [стрелка=нет];
подпись -> threepoverhang [стрелка=нет];

Fivepoverhang [shape=fivepoverhang label=""];
подпись [форма=подпись];
threepoverhang [shape=threepoverhang label=""];

}
 

Загрузить:

Загрузить с официального сайта Graphviz

Все моментальные снимки разработки новее 2. 29.20120924 должны иметь символы, совместимые с SBOLv, а также символы схемы, не относящиеся к SBOLv ( л промоутер , рэрроу, и т.д.).

Примеры диаграмм:

орграф а {
рангдир = LR;

подграф кластер0 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
а -> б [стрелка = нет];
б -> с [стрелка = нет];
}

[shape=promoter label=""];
b [shape=cds label="rtTA"];
c [форма = метка терминатора = ""];

Докс -> rtTA;
б -> ртТА;

подграф кластер1 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
д -> е [стрелка = нет];
e -> f [стрелка = нет];
}

д [форма = ярлык промоутера = ""];
e [shape=cds label="Альфа"];
f [форма=метка терминатора=""];

ртТА -> д;
е -> Альфа;

подграф кластер2 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
г -> ч [стрелка = нет];
ч -> я [стрелка = нет];
}

g [shape=promoter label=""];
h [shape=cds label="Альфа"];
я [форма = метка терминатора = ""];

Альфа -> г;
ч -> Альфа;

}

 

орграф G {
рангдир = LR;

подграф кластер0 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
а -> б [стрелка = нет];
б -> с [стрелка = нет];
c -> d [стрелка=нет];
}

[shape=promoter label=""];
b [shape=cds label="rtTA"];
c [shape=cds label="LacI"];
д [форма = метка терминатора = ""];

Докс -> rtTA;
б -> ртТА;

подграф кластер1 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
e -> f [стрелка = нет];
f -> g [стрелка = нет];
г -> ч [стрелка = нет];
}

e [shape=promoter label=""];
f [shape=cds label="Чарли"];
g [shape=cds label="Альфа"];
h [форма = метка терминатора = ""];

ртТА -> е;

с -> LacI;
IPTG -> LacI [стрелка=тройник];

подграф кластер2 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
я -> j [стрелка = нет];
j -> k [стрелка=нет];
k -> l [стрелка=нет];
}

я [форма = ярлык промоутера = ""];
j [shape=cds label="Индия"];
k [shape=cds label="Браво"];
л [форма = метка терминатора = ""];

LacI -> i [наконечник=тройник];

е -> Чарли;
г -> Альфа;
j -> Индия;
к -> Браво;

кластер подграфов3 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
м -> п [стрелка = нет];
п -> о [стрелка = нет];
о -> р [стрелка = нет];
}

м [форма = ярлык промоутера = ""];
n [shape=cds label="Чарли"];
о [shape=cds label="Альфа"];
p [форма = метка терминатора = ""];

п -> Чарли;
о -> Альфа;
Альфа -> м;

кластер подграфов4 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
q -> r [стрелка = нет];
r -> s [стрелка = нет];
s -> t [стрелка = нет];
т -> и [стрелка = нет];
}

q [форма = ярлык промоутера = ""];
r [shape=cds label="Индия"];
s [shape=cds label="Браво"];
t [shape=cds label="EYFP"];
u [форма = метка терминатора = ""];

г -> Индия;
с -> Браво;
т -> ЭЙФП;

кластер подграфов5 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
v -> w [стрелка = нет];
ш -> х [стрелка = нет];
}

v [shape=метка промоутера=""];
w [shape=cds label="Отель"];
х [форма = метка терминатора = ""];

Чарли -> v [стрелка = тройник];
ж -> Гостиница;

кластер подграфов6 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
у -> г [стрелка = нет];
г -> аа [стрелка = нет];
}

y [shape=промоутер label=""];
z [shape=cds label="Фокстрот"];
аа [форма = метка терминатора = ""];

Отель -> y [стрелка = тройник];
Индия -> г [наконечник = тройник];

г -> Фокстрот;

кластер подграфов7 {
цвет=серый;
стиль=заполненный;
узел [style=filled fillcolor=white];
bb -> cc [стрелка=нет];
копия -> дд [стрелка = нет];
дд -> ее [стрелка = нет];
}

бб [форма = ярлык промоутера = ""];
cc [shape=cds label="EBFP2"];
дд [shape=cds label="Фокстрот"];
ee [shape=метка терминатора=""];

Фокстрот -> бб;
дд -> фокстрот;

копия -> EBFP2;

}
 

Предупреждения:

Цвет и маркировка работают не так хорошо, как символы, не относящиеся к SBOLv.

Метки, которые включают двухцепочечную линию ДНК, такую ​​как промотор, должны иметь labelloc, установленный на «b». Это делается для того, чтобы избежать пересечения метки и двухцепочечной линии ДНК, поскольку метки автоматически размещаются в центре узлов.

Hef1a [форма=промотор];

 

Hef1a [форма=промоутер labelloc="b"];

 

Кроме того, для вышеупомянутых форм вместо цвета необходимо указать заливку цветом. color будет окрашивать контур формы узла, потенциально вызывая непоследовательную окраску двухцепочечной линии ДНК между соединенными узлами.

Hef1a [shape=promoter labelloc="b" style=filled colorscheme=greens3 color=3];

 

Hef1a [shape=promoter labelloc="b" style=filled colorscheme=greens3 fillcolor=3];

 

Благодарности:

Спасибо Решме Шетти и Джейку Билу за вдохновение.

[обновлено: Graphviz + SBOLv1. 0]

1. Введение

Graphviz — это мощный инструмент с открытым исходным кодом для визуализации графиков и сетей.

Создав несколько значимых фигур, я задействовал его способность построения диаграмм для рисования генетических цепей. Схемы генетических цепей теперь можно задавать в виде простого текстового файла. Алгоритмы визуализации Graphviz обрабатывают все размещения и выравнивания. Необходимо указать только имена узлов и ребер. Ниже приведен пример генетической схемы, созданной Graphviz.

Я был вдохновлен на создание этого инструмента после утомительного склеивания форм для печенья для конкурса iGEM 2011 года. Для нашего проекта iGEM было переработано множество подсхем без хорошего способа переработки соответствующих схем. С моими новыми формами узлов в Graphviz указать модули схемы так же просто, как несколько коротких строк текста. С помощью небольшого сценария Graphviz позволяет быстро создавать схемы генетических цепей и становится гораздо более эффективным и мощным, чем методы копирования и вставки или инструменты на основе графического интерфейса.

доступно обновление проекта с символами, совместимыми с SBOLv

2. Загрузить

Пользовательские формы генетической цепи: и правый промоутер и формы левой и правой стрелок.

Они были включены в официальные формы узлов Graphviz.

Скачать Graphviz с официального сайта

В качестве бэкапа также размещаю два билда. Во-первых, это сборка с исходным кодом, готовая к использованию для Linux. Это стабильная версия Graphviz 2.28 с добавленными фигурами. Во-вторых, это сборка для разработки Graphviz 2.29.устанавливается на MacOS. Я протестировал его на Mac OS 10.6.8, и он работает.

Исходная сборка Linux (модифицированный Graphviz 2.28):
Загрузить

Сборка MacOS/Snow Leopard (Graphviz 2.29.20120828):
Загрузить

3. Галерея

Графвиз. Под изображениями находится содержимое текстовых файлов, используемых для создания этих изображений.

орграф г {
рангдир = LR;

БАС -> NCAD [стрелка=нет];
УАС [форма=rпромотор];
NCAD [форма=прямоугольник];

}

 

орграф г {
рангдир = LR;

а -> б [стрелка = нет];
б -> с [стрелка = нет];
c -> d [стрелка=нет];
[shape=rpromoter label="UAS"];
b [shape=прямоугольная метка="LacI"];
c [shape=rpromoter label="UAS"];
д [форма = прямоугольная метка = "Репортер"];

}

 

орграф G {
рангдир = LR;

узел [shape=rpromoter colorscheme=rdbu5 color=1 style=filled fontcolor=3]; Hef1а; ТР;
узел [shape=rarrow colorscheme=rdbu5 color=5 style=filled fontcolor=3]; ртТА3; ДельтамЧерри;
продукт [shape=oval style=filled colorscheme=rdbu5 color=2 label=""];
узел [форма = овальный стиль = заполненная цветовая схема = цвет rdbu5 = 4, цвет шрифта = 5];
комбинация [label="rtTA3 + доксициклин"];
rtTA3protein [метка = "rtTA3"];

подграф кластер_0 {
цвет=белый;
Hef1a -> rtTA3 [стрелка=нет];
rtTA3 -> TRE [стрелка=нет];
TRE -> DeltamCherry [стрелка = нет];
}

rtTA3 -> белок rtTA3;
белок rtTA3 -> комбинация;
Доксициклин -> комбинация;
комбинация -> ТРЭ;
ДельтамЧерри -> продукт;

Hef1a [shape=rpromoter colorscheme=rdbu5 color=1 fontcolor=3 style=filled];
rtTA3 [shape=rarrow colorscheme=rdbu5 color=5 fontcolor=3 style=filled];
TRE [shape=rpromoter colorscheme=rdbu5 color=1 fontcolor=3 style=filled];
DeltamCherry [shape=rarrow colorscheme=rdbu5 color=5 fontcolor=3 style=filled label="Delta-mCherry"];

Доксициклин [style=filled colorscheme=rdbu5 color=4 fontcolor=5];
rtTA3protein [style=filled colorscheme=rdbu5 color=4 label="rtTA3" fontcolor=5];
комбинация [style=filled colorscheme=rdbu5 color=4 label="rtTA + Doxcycline" fontcolor=5];
продукт [style=filled colorscheme=rdbu5 color=2 label=""];
}
 

орграф г {
рангдир = LR;

узел [shape=rpromoter colorscheme=rdbu5 color=1 style=filled fontcolor=3]; Hef1а; ТР; УАС; Hef1aLacOid;
Hef1aLacOid [метка = "Hef1a-LacOid"];
узел [shape=rarrow colorscheme=rdbu5 color=5 style=filled fontcolor=3]; Гал4ВП16; Лаци; ртТА3; ДельтамЧерри;
Gal4VP16 [метка = "Gal4-VP16"];
продукт [shape=oval style=filled colorscheme=rdbu5 color=2 label=""];
репрессии [shape=oval label="LacI репрессии" fontcolor=black style=dotted];
узел [форма = овальный стиль = заполненная цветовая схема = цвет rdbu5 = 4, цвет шрифта = 5];
комбинация [label="rtTA3 + доксициклин"];
LacIprotein [метка = "LacI"];
rtTA3protein [метка = "rtTA3"];
белок Gal4VP16 [label="Gal4-VP16"];

подграф кластер_0 {
цветовая схема = rdbu5;
цвет=3;
узел [colorscheme=rdbu5 fontcolor=3];
Hef1a -> Gal4VP16 [стрелка=нет];
Gal4VP16 -> БАС [стрелка=нет];
UAS -> LacI [стрелка=нет];
LacI -> Hef1aLacOid [стрелка=нет];
Hef1aLacOid -> rtTA3 [стрелка=нет];
rtTA3 -> TRE [стрелка=нет];
TRE -> DeltamCherry [стрелка = нет]
}

Gal4VP16 -> белок Gal4VP16;
белок Gal4VP16 -> UAS;
LacI -> LacIпротеин;
LacIprotein -> репрессия;
репрессии -> Hef1aLacOid [стрелка=тройник];
IPTG -> репрессии [стрелка=тройник];
rtTA3 -> белок rtTA3;
белок rtTA3 -> комбинация;
комбинация -> ТРЭ;
Доксициклин -> комбинация;
ДельтамЧерри -> продукт;

}
 

5. Благодарность

Особая благодарность моим друзьям Роберту Макинтайру и Дилану Холмсу за помощь в составлении GraphViz.

1. Введение

absee — дружественная программа для чтения ABIF на Ruby.

Три года назад мне крайне необходимо было проанализировать следовые значения хроматограмм секвенирования ДНК (в виде файлов ABIF). К моему разочарованию, ни один из доступных считывателей ABIF не экспортировал необработанные данные. Даже сегодня, несмотря на то, что многие программы способны визуализировать файлы ABIF, очень немногие из них допускают входные данные по сценарию и пользовательские манипуляции с выходными данными. Мне нужен считыватель ABIF, который просто извлекает данные и может быть легко включен в другие проекты. Следовательно, я создал absee.

absee — рубиновый драгоценный камень. У него нет графического интерфейса, нет пуха. Он просто считывает файлы ABIF и возвращает значения в шести массивах, массив для каждого из данных трассировки для ACGT с дискретными интервалами, вызываемую последовательность и массив индексов пиков, соответствующих вызываемой последовательности.

% руб.
>> требуется 'отсутствовать'
=> правда
>> читатьAB("my_sequence.ab1")
 

С помощью простого скрипта Ruby его можно включить для быстрого чтения и обработки множества файлов ABIF и передачи данных для дальнейшей последующей обработки. absee — очень изящный инструмент, который я хотел бы иметь три года назад. Приведенный выше код работает для версий ниже 0.1.0.0.

[обновление: новая версия модуля Ruby]

2. Исходная информация

ABIF — это двоичный формат файла, обычно с расширением .ab1. Он содержит значение трассировки для A, C, G и T в каждой точке интервала. Большинство программ просмотра ABIF будут интерполировать эти значения в точках для отображения синусоидальных линий.

Файлы ABIF также содержат оценочные базовые и пиковые индексы. Способ, которым секвенирование ДНК извлекает последовательность из данных трассировки, заключается в использовании алгоритма базового вызова. Алгоритм базового вызова оценит пик в данных трассировки и определит вызываемую базу для пика. Если пики более чем одной трассы перекрываются и их значения достаточно близки, алгоритм может использовать N для обозначения неопределенности базы для этого пика и снижения показателя качества. Последовательность названных оснований представляет собой предполагаемую последовательность ДНК, соответствующую хроматограмме.

3. Подробности

Преобразование двоичных файлов ABIF в читаемые значения было непростым делом. Даже с готовой архитектурой файлового формата мне все еще нужно было небольшое руководство. Несколько лет назад я нашел программу просмотра ABIF с открытым исходным кодом (теперь она больше не доступна) и перевел absee из программы чтения ABIF.

Основной метод для вызова — readAB. Он открывает файл ABIF, проверяя тип и версию файла. Основные версии ABIF выше 1 не поддерживаются из-за возможных различий в кодировках. Если проверка не пройдена, readAB вернет шесть пустых массивов.

readAB(имя файла)

• параметры:
  имя файла: строка, содержащая имя файла (включая путь и расширение)
• возвращает:
  шесть массивов, которые представляют собой данные трассировки для A, C, G, T, называемые индексами последовательностей и пиков

Дополнительную документацию можно найти в absee’s yardoc/RDoc, а также исходный код на github.

4. Исходный код

Исходный код версии 0.0.2.3 можно найти в отсутствующем репозитории github.

Easy Machine Узор баттенбург/каре BP3 с утюгом

Нажмите, чтобы увеличить

2823 продажи
|

€7,07

Загрузка

Доступен только 1

Включая НДС (где применимо), плюс стоимость доставки

Редкая находка — этот предмет трудно найти.

Исследуйте другие похожие поисковые запросы

Внесен в список 21 октября 2022 г.

8 избранных

Сообщить об этом элементе в Etsy

Выберите причину… С моим заказом возникла проблемаОн использует мою интеллектуальную собственность без разрешенияЯ не думаю, что это соответствует политике EtsyВыберите причину…

Первое, что вы должны сделать, это связаться с продавцом напрямую.

Если вы уже сделали это, ваш товар не прибыл или не соответствует описанию, вы можете сообщить об этом Etsy, открыв кейс.

Сообщить о проблеме с заказом

Мы очень серьезно относимся к вопросам интеллектуальной собственности, но многие из этих проблем могут быть решены непосредственно заинтересованными сторонами. Мы рекомендуем связаться с продавцом напрямую, чтобы уважительно поделиться своими проблемами.

Если вы хотите подать заявление о нарушении авторских прав, вам необходимо выполнить процедуру, описанную в нашей Политике в отношении авторских прав и интеллектуальной собственности.

Посмотрите, как мы определяем ручную работу, винтаж и расходные материалы

Посмотреть список запрещенных предметов и материалов

Ознакомьтесь с нашей политикой в ​​отношении контента для взрослых

Товар на продажу…

не ручная работа

не винтаж (20+ лет)

не ремесленные принадлежности

запрещены или используют запрещенные материалы

неправильно помечен как содержимое для взрослых

Пожалуйста, выберите причину

Расскажите нам больше о том, как этот элемент нарушает наши правила.